ทั้งนี้การรถไฟยังได้ติดตามสถานการณ์ฝนตกหนักติดต่อกันหลายวันจนเกิดปริมาณน้ำฝนสะสมเข้าท่วมพื้นที่หลายจังหวัดในภาคใต้ ดังนั้นการรถไฟจึงขอแจ้งการเปิดให้ บริการเดินรถ และการปรับเปลี่ยนสถานีต้นทาง ปลายทาง ของรถไฟในเส้นทางสายใต้ในวันที่ 5-6 มกราคม 2560 เพื่อให้เกิดความเหมาะสมกับสถานการณ์และความปลอดภัย

โดยจะเปิดเดินรถในเส้นทางสายใต้เหลือเพียง 5 ขบวน โดยทุกขบวนสิ้นสุดถึงแค่สถานีรถไฟชุมพรเท่านั้น ได้แก่ ขบวนรถด่วนพิเศษดีเซลรางที่ 43 กรุงเทพฯ-สุราษฎร์ธานี ขบวนรถเร็วที่ 171 กรุงเทพฯ-สุไหงโก-ลก และขบวนรถเร็วที่ 173 กรุงเทพฯ-นครศรีธรรมราช ขบวนรถด่วนที่ 85 กรุงเทพฯ-นครศรีธรรมราช ขบวนรถด่วนพิเศษดีเซลรางที่ 39 กรุงเทพฯ-สุราษฎร์ธานี

สำหรับผู้โดยสารที่จองตั๋วล่วงหน้าไปยังจังหวัดต่างๆ ทางภาคใต้แล้ว สามารถติดต่อเพื่อขอคืนเงินค่าโดยสารได้เต็มราคา และในช่วงนี้ขอแจ้งว่าการรถไฟฯ จะไม่มีบริการขนถ่ายผู้โดยสารต่อทางรถยนต์ เนื่องจากเส้นทางถนนมีน้ำท่วมสูงเช่นกัน ขณะเดียวกันขอความร่วมมือให้ผู้โดยสารที่มีความประสงค์เดินทางในเส้นทางรถไฟสายใต้ ให้ตรวจสอบและติดต่อสอบถามรายละเอียดเป็นระยะๆ ก่อนเดินทาง ได้ที่สายด่วนโทร. 1690 ตลอด 24 ชั่วโมง.