โดยทางญี่ปุ่นได้เข้ามาช่วยศึกษาแผนพัฒนาพื้นที่ทั้งในส่วนของสถานีกลางบางซื่อ ซึ่งมีเป้าหมายหลักคือ พัฒนาพื้นที่ดังกล่าวให้เป็นศูนย์กลางด้านการคมนาคมขนส่งและระบบโลจิสติกส์ของประเทศและในภูมิภาคอาเซียน อย่างไรก็ตาม ทางญี่ปุ่นสนใจลงทุนพัฒนาพื้นที่ดินบริเวณสถานีมักกะสันมากกว่าพื้นที่สถานีกลางบางซื่อ โดยมีแนวคิดเบื้องต้นว่าจะพัฒนาพื้นที่มักกะสัน เน้นเรื่องของอสังหาริมทรัพย์ที่สามารถเชื่อมโยงกับเขตเศรษฐกิจพิเศษภาคตะวันออก (EEC) โดยเฉพาะสถานีมักกะสันจะกลายเป็นศูนย์กลางการเชื่อมโยงต่อของ EEC และเป็นจุดเชื่อมต่อของ 3 สนามบินระหว่างอู่ตะเภา-สุวรรณภูมิ-ดอนเมืองด้วย.