นอกจากนี้ ยังพบว่าคณะทำงานได้อนุมัติขายข้าวให้กับกลุ่มอุตสาหกรรมปุ๋ยอินทรีย์ และกลุ่มอุตสาหกรรมพลังงานที่เสนอราคาซื้อสูงสุด ซึ่งเป็นบริษัทที่ไม่มีเหตุผลทางการตลาด การค้า เช่น กลุ่มผลิตปุ๋ยอินทรีย์ เพราะการอนุมัติขายให้กลุ่มอุตสาหกรรมเหล่านี้ เมื่อพิจารณาแล้วไม่คุ้มกับต้นทุนการนำไปเป็นวัตถุดิบผลิตปุ๋ย แต่คณะทำงานกลับพิจารณาขายให้ 2 ราย จำนวน 29 คลัง ปริมาณ 202,000 ตัน เฉลี่ยตันละ 3,319.41 บาท และอนุมัติให้กับกลุ่มที่นำไปผลิตพลังงานชีวมวล 8 ราย 30 คลัง ปริมาณ 144,000 ตัน รวมปริมาณที่อนุมัติขาย 500,000 ตัน มูลค่า 1,522.79 ล้านบาท ทั้งนี้ มีการตั้งข้อสังเกตว่า หากปริมาณข้าวสารที่อนุมัติขายครั้งนี้ทั้ง 500,000 ตัน หมุนเวียนกลับมาในระบบตลาดข้าวปกติ จะมีรายได้ส่วนต่างจากราคาประมูลและราคาตลาดสูงถึง 2,500-3,000 ล้านบาท และจะส่งผลกระทบต่อระบบการค้าข้าวในตลาดได้ บริษัท ที พี เค เอทานอล จำกัด จึงส่งหนังสือขอความเป็นธรรมให้รัฐบาลช่วยตรวจสอบผลการพิจารณาว่าบริษัทที่ได้รับการอนุมัติขายนั้น มีส่วนเกี่ยวข้องกับกลุ่มการค้าข้าวหรือไม่.