ลักษณะเฉพาะของการตรวจเยี่ยมฟาร์มเพื่อนแบบมีส่วนร่วม เป็นการตรวจประเมินการทำตามมาตรฐานเกษตรอินทรีย์ของกลุ่ม โดยคณะผู้ตรวจเยี่ยมซึ่งเป็นเกษตรกรด้วยกัน แต่ได้รับการแต่งตั้งจากกลุ่ม ซึ่งอาจมีที่ปรึกษากลุ่มหรือผู้บริโภคเข้าร่วมตรวจด้วย โดยรูปแบบการตรวจไม่ใช่การจับผิดหรือตรวจตามข้อกำหนดเท่านั้น แต่เป็นการตรวจสอบความเข้าใจในมาตรฐานและวิธีปฏิบัติในฟาร์ม และแลกเปลี่ยนเรียนรู้กันถึงแนวทางการปฏิบัติที่สอดคล้องกับมาตรฐาน

การตรวจเยี่ยมฟาร์มเป็นแบบเพื่อนเยี่ยมเพื่อน ซึ่งฟาร์มหรือสถานที่ผลิตต้องได้รับการตรวจอย่างน้อยปีละ 1-2 ครั้ง โดยไม่แจ้งให้ทราบล่วงหน้า การตรวจฟาร์มกระทำโดยคณะกรรมการตรวจเยี่ยมอย่างน้อย 3 คน ซึ่งคณะกรรมการจะต้องไม่ตรวจฟาร์มตนเองหรือญาติพี่น้อง รูปแบบการตรวจอาจเป็นการให้คำแนะนำ หรือการเรียนรู้ร่วมกันเพื่อการพัฒนา โดยในปีแรกหากเจ้าของฟาร์มไม่มีทักษะพอ ที่ปรึกษาจะต้องร่วมตรวจและสอนไปด้วย แต่ผู้ตรวจฟาร์มจะไม่มีอำนาจตัดสินการให้การรับรอง ต้องนำผลเข้าที่ประชุมเพื่อให้คณะกรรมการให้การรับรอง

การไม่ผ่านการตรวจประเมินไม่ได้หมายความว่าทำผิด แต่เป็นการให้ผู้ผลิตเรียนรู้เพื่อพัฒนาการผลิตให้สอดคล้องกับมาตรฐาน สุดท้ายสมาชิกต้องแสดเจตจำนงการปฏิบัติตามมาตรฐานเกษตรอินทรีย์ของกลุ่ม มีวิธีปฏิบัติที่หลากหลาย เช่น การจัดทำแผนการผลิตเป็นเอกสาร หากผู้ผลิตทำได้จะเป็นวิธีที่ดีที่สุด เนื่องจากตรวจสอบได้ง่าย การทำสัญญาหรือปฏิญาณของผู้ผลิต อาจเป็นสัญญาเดี่ยวหรือของกลุ่มและมีการเซ็นชื่อต่อกันในการปฏิบัติตามมาตรฐานและกฎหมายกติกาของกลุ่ม และมีบันทึกการตรวจประเมินฟาร์มของกลุ่มระบุวันตรวจ และเซ็นชื่อทั้งผู้ตรวจและผู้รับการตรวจ การเสริมสร้างความรู้ และการมีส่วนร่วมในกิจกรรมที่หลากหลาย